《中华民国史档案资料丛书》，是为了适应中国近现代史和民国史的教学和科研需要，就馆藏具有一定史料价值的独立成帙的档案资料，如年谱、日记、未刊书稿。重要党政军会议记录和工作报告，调查统计资料等选辑而成的一套档案资料丛书。本《丛书》由万仁元、方庆秋主编，于1988年起，陆续编辑出版。《抗日战争时期国民党军机密作战日记》，是本《丛书》的一种。全书分为七个部份{一]军委会委员长天水行营等机密作战日记：[二]第一第二战区机密作战日记污三]第三第四战区机密作战日记真：[四]第五战区机密作战日记：[五]第七第九战区机密作战日记[六]鲁苏、冀察战区机密作战日记[七]第十第十二战区机密作战日记。这些日记，主要记载了1939年1月至1945年12月国民党军对日作战和抗日民族统一战线内部国民党军制造反共磨擦的作战情况，是研究国民党在武汉、广州沦陷后从片面抗战转到消极抗战积极反共的重要史料。