本书第一版于1997年出版，该书获得1999年“全国优秀科技图书奖”暨“科技进步奖（科技著作）”二等奖和第四届国家图书奖提名奖。台湾艺轩图书出版社还在台湾和香港两地发行了繁体字版本，扩大了本教科书在港台地区的影响。
《现代分子生物学》第二版增加了果蝇体节发育、癌症和艾滋病的发生发展等内容，删去了第一版中有关植物分子生物学的部分章节。新版本仍然分为10章，分别对染色体结构、DNA的复制形式与特点、DNA的转座、遗传密码的破译、蛋白质的合成和运转、基因表达调控的原理、癌症与癌基因活化、免疫缺损病毒（HIV）的分子机制等重大问题作了全面系统的分析，其中第三至九章以较大篇幅叙述了参与原核、真核细胞基因表达调控的各种元件，探讨了DNA甲基化、蛋白质磷酸化及各种不同环境因子对基因活性和基因功能的影响，第十章则讨论了基因组学与比较基因组学研究的最新成果。
本书可供高等院校生物科学和生物技术专业的教师和学生使用，也可供从事相关专业的教师和学生参考。