本书配套郑虎主编的《药物化学》5版使用，全书的章节与该书一致，共13章。每一章内分为五个部分：学习要求、术语解释、主要内容、自测练习和案例学习。
学习要求中写明了该章中应掌握、熟悉和了解的内容。各章集中在一起即成为药物化学课程的教学大纲。
术语解释主要列出和解释了我们认为有助于学习该章的一些术语。
　　主要内容部分是原书各章的重点、难点的解析。这部分不是原书的摘要，在一些地方相比原书都有加工和补充。同时，为了节省篇幅，对原书写得很明白的地方，没作重复，一些图和表也用参见的方式表示。
　　自测练习中有五个类型的习题，都是各个学校和国家考试中常用的题型。考虑到本书不作为学生的应试题集，编选的题目更注重引导学生思考与分析。有一些题较有深度和难度，教材上并无现成的答案。本书后提供了参考答案。问题题答案还标明了教材的页码。