本教材遵循三基和五性的原则，密切结合医学本科教育的培养目标进行编写。在教材内容的选编方面做了改革，主要特点有：
　　（1）结合我国西部地区的特点，对近年来新发现和再出现的感染性疾病及其病原体进行重点介绍，删除了部分关联不大的陈旧内容。
　　（2）在编排形式方面，根据本学科的基本要求和教学规律，把医生微生物学基础放在第一篇，在逃生掌握了细菌、病毒等微生物的共性和研究方法的基础上，再分别介绍各类微生物的特点，有利于学生前后联系进行纵向和横向的比较。
　　（3）在编写中强调了以预防为主的思想。对突发性的公共卫生事件的监测、预警和控制，以及加强实验室生物安全生防护等。在有关章节内进行了介绍。