《基因工程实验指导》以基因克隆为主线，选编了35个实验，包含了从核酸与质粒的提取、基因文库构建与筛选、基因分离方法的确定、PCR法获得基因、克隆载体和表达载体的重组、重组子的鉴定，基因的表达到表达产物——蛋白的纯化、鉴定等相关的实验技术内容。同一实验项目提供了多种可供选择的实验方法，并强调指出了实验中的注意事项，还对与实验相关的内容进行了评议。选编的实验内容衔接紧密，在实际教学时，可以针对不同层次、不同学时数的要求，既可以集中在两个星期连续进行，也可以分成十次实验阶段性完成。为提高教学效率，作者还将实验安排分时段详细列于实验计划表中，便于教师组织实验教学。