《中国哲学十二讲》围绕中国哲学在各个历史时期讨论的主要问题，即从先秦天人之辩、名实之争，到两汉字宙论上的或使莫为之争、魏晋有无及言意之辩、隋唐佛道哲学对于宗教境界的讨论、宋明理学时期的理气(道器)之争和心物(知行)之辩，再到明清之际哲学家对于整个古代哲学尤其宋明理学的批判总结，最后到近代哲学在历史观和认识论(心物知行关系)的转型，展开其从先秦到近代的发展历程；以及新时期20多年来中国大陆哲学研究的主要趋向，和来自海峡对岸的中国台湾地区学术界对这一时期中国大陆哲学研究的评论。