《区域经济不平衡发展论》分为理论篇和应用篇，共计十三章。理论篇包括第一至第八章，主要从概念界定、理论流派、影响因素、模型分析、要素流动、区际贸易、结构转换、政策体系等方面阐述区域经济不平衡发展的内在机理和基本特征，力图构建区域经济不平衡发展的理论框架。应用篇包括第九章至第十三章，主要应用区域经济不平衡发展理论，从地区可持续竞争力、国家区域政策体系、知识技术型特色经济、石油资源型城市可持续发展、开发园区土地利用与管理等方面进行实证分析，力求从我国区域经济的不同领域和角度体现区域经济不平衡发展的理念和思想。
处于工业化和城镇化快速推进的发展中国家，区域经济不平衡发展的问题如果不能及时有效地加以解决，将会影响工业化和城镇化进程的稳步推进，这同样对于加强区域经济不平衡发展的理论和政策研究提出了迫切要求。《区域经济不平衡发展论》重点研究国家内部的区域经济不平衡发展现象，力图总结发达国家工业化和城镇化进程中的区域经济不平衡发展经验教训，结合目前发展中国家区域经济不平衡发展新的形势和特征，提出关于区域经济不平衡发展的理论体系，并结合我国区域经济发展的客观实际进行实证研究。