《闽台历代中医医家志》从闽台历代中医医家的生平、专业活动、著作、现存版本、珍本稀本现存的藏书地点、解放后已整理出版的历代闽籍医家著作状况等方面，进行收集整理；并且运用多种检索手段，如笔划索引、拼音索引、朝代索引等，使人们更方便、简捷地对闽台历代中医医家有一个多维的、立体的认识，力求使之成为一部能较全面、客观、准确地反映闽台历代中医医家的医事活动及其业绩，科学地反映作为闽台历代中医医家文化载体之一——著作的现况，体现闽台两省历代中医医家交流与传承传统医药文化的历程和发展之著作。
福建（简称闽）与台湾（简称台）仅一水之隔，相同的地缘、亲缘、血缘、文缘、商缘，使得十分丰富的传统中医药，融入了两岸人民的健康理念之中。该书从医家的角度，分福建与台湾两部分，以历史发展为脉络，收载了于1950年12月31日之前断限内的闽台两省历代中医医家；对于部分医家主要的行医活动在1950年12月31日之前，但卒于1960年12月31日之前的亦予以收载。共收载闽台两省历代中医医家计1066人。