《海南岛生态环境变迁研究》旨在描述和阐释海南岛生态环境在人类活动的干扰下的变迁过程、原因及其生态后果，并在此基础上提出保护海南岛生态环境的新理念——创建海南生态特区。研究的空间范围是海南岛，研究的主要对象是植物、动物和气候的变迁，时间上溯到第四纪全新世初，时间跨越上万年。
《海南岛生态环境变迁研究》共分为8个部分。第一部分是海南岛第四纪古气候及古生物环境的研究，第二部分是海南岛森林变迁的研究，第三部分是海南岛著名林木变迁的研究，第四部分是海南岛外来作物(植物)引种史的研究，第五部分是海南岛野生动物变迁的研究，第六部分是海南岛的气候变迁史的研究，第七部分是对因海南岛生态变迁而导致的几种主要的生态后果的研究，第八部分是关于人与自然的思考和关于海南生态保护及建设的建议。
本研究以历史学叙述为本，开创性地整合了古植物学、古动物学、古气候学、考古学、人类学、文献学、社会学、现代生态学、生物学等学科的研究成果和研究方法，突破了学科之间特别是自然科学与人文科学之间的分界线，在环境史研究方法上具有较大突破。