《当代欠发达地区产业发展的系统分析原理》对于产业创新治理机制与产业技术、市场结构特征之间关系的分析和探索，也值得在理论研究与实践中重视。不言而喻，对于创新主体而言，技术复杂程度越高，不确定性风险就越高。如果产业市场结构是高度竞争的，则意味着创新成果有较多的淕　在需求者，资产专用性程度较低，被“销定”的风险较小；反之，如果产业市场结构的集中度较高，垄断较为严重则可能出现较高的资产专用性，创新主体投入到创新过程中的相关资产被“锁定”的风险也必然较大。因此无论是产业技术特征还是市场结构特征都会对产业创新过程中的交易成本产生重要作用从而影响产业创新的绩效。