《医学微生物学》主要内容包括：第一篇为医学微生物学基础篇，分别由导论、细菌学总论、病毒学总论、真菌学总论、遗传与变异，抗感染免疫，消毒、灭菌及生物安全，病原微生物感染的诊断与防治有关的章节组成。第二篇至第四篇分别为细菌学各论、病毒学各论和真菌学各论，主要对典型或有代表性的常见病原性细菌、病毒、真菌进行详细介绍。第五篇为微生物学实验教程，处介绍医学微生物学基本实验和操作技能外，增加了细菌和病毒的分子生物学诊断两章。
《医学微生物学》适用于临床、基础、预防、护理、检验、口腔、药学等专业的五年制、七年制学生，还可作为临床医生及科研人员参考用书。