《软件知识产权保护制度研究》以对软件知识产权保护历史实践与模式比较的讨论为起点，探讨了在软件产业中用经济学方法研究知识产权保护制度问题的可行性。在此基础之上，运用经济学模型讨论和比较了软件的各种知识产权保护制度，进而分述具体的软件的版权保护制度和专利保护制度。在软件的版权保护制度的经济学分析中，讨论了累积创新与版权保护的关系。在软件的专利保护制度的经济学分析中，讨论了专利期限政策与专利保护的关系。分别考虑在这些不同条件下的软件保护模型和适用的软件保护制度。之后，将软件保护问题置于国际层面上，考虑TRIPS协议下的软件保护问题。最后以中国的软件知识产权保护问题作为落脚点，对中国计算机软件保护政策提出一些构想。