《细胞生物学简明教程》全书共十三章分为四个单元。单元划分遵循由表及里、从微观到宏观的顺序架构，符合结构与功能相适应、局部与整体相统一的生命科学观点。第一单元细胞与医学。通过描述细胞的共性及细胞学说，建立细胞的概念；通过揭示人类健康和疾病的细胞基础，阐明细胞生物学与医学的关系。
第二单元细胞微环境与细胞边界。用生态学的观点，揭示细胞与其生活的微环境之间的关系，明确细胞离不开周围环境；本单元从外围入手，使学生认识到质膜是细胞的界线，担负着与外界物质交换的重任。