《生理学》第五版编写的指导思想是，继续保留四版教材的优点，充分体现专科教育的特色，进一步突出教材的思想性、科学性、先进性、启发性和适用性，以适应新世纪培养全科医生的需要。
　　编写过程中注重精选内容，既强调打好基础，充分阐述医学专科学生所需的生理学基本理论、基本知识，同时又注意体现学科的进展，如增加了细胞的信号转导功能等内容，使学生了解学科发展的前沿状况，但总的原则仍以“必须、够用”为度。对有些内容如骨骼肌的收缩功能、心脏生理、能量代谢等的编排做了调整，使之更符合生理过程的发生规律；消化与吸收一章的调整使结构编排更加简明，减少了复复。
　　新教材特别重视精选、精制插图，按照简明扼要的原则，使学生看图之后对某些复杂的内容能获得一个简要的知识框架。用计算机绘制了部分插图，增加了立体感，提高了质量。
　　本版教材增加了英文专业词汇索引，以利于学生专业英语学心。在书末还增加了参考资料，有利于学生通过自学扩展知识。