本版教材各章都充实和反映了本学科的新进展，增加了与疾病关系密切的细胞分子生物学新知识、新概念，如基因突变与疾病、细胞信号转导与疾病、细胞增殖分化和凋亡调控障碍、自由基与疾病等。本着从机体、器官、细胞和分子水平阐明疾病发生发展过程的总体思路，全书由四部分组成：第一部分为“总论”（第一、二章）；第二部分为“细胞与分子病理生理学”（第三～六章）；第三部分为“基本病理过程的病理生理学”（第七～十三章），其中增加了肿瘤病理生理学，重点介绍癌基因与肿瘤的新进展；第四部分为“器官系统病理生理学”（第十四～十八章节）。此外，还将有关内容作了适当调整和扩展，如将弥散性血管内凝血融入凝血与抗凝血平衡紊乱，将多器官功能衰竭并入休克中，以增强专业知识的内在联系和逻辑性。