《现代中医论》的主要内容是：现代中医诞生在中国的改革开放时期，这是自然的，这是中医谋求在当代人类科技水平领域进步的必然选择。以中医药作为治病方法，所阐述的是当代先进的医学科学思维观念，所实证的是当前最优秀的临床疗效，这就是现代中医。以辩证唯物论为认识论，以世界多样性理论和科学发展观的哲学思想为方法论，在继承传统中医优秀医学成果的基础上，站在人类医学进步的高度，站在人类科学与技术进步的高度，站在人类社会的文明与进步的高度，来衡量现代中医医学成果的研究水平，这是现代中医学科的研究方式。
现代中医标明了中医学科的发展方向，阐明了未来中医的研究方式和研究方法，展示了传统中医迈向现代中医的如铁一般艰难的这一步。
现代中医这门学科尚处在稚形阶段，但已问鼎了世人瞩目的重大医学科学领域，并得到了医学主流学者的普遍认同。可以预期，这门新兴的学科在为人类健康事业服务的过程中，将显现出十分重要的地位和价值。也十分期望更多的中西医同道来共同参与这门学科的建设，使这门学科更具先进性、完整性、系统性。