《教育部人才培养模式改革和开放教育试点教材:农村环保概论》共分为十二章。第一章为绪论；第二章为农业自然资源的可持续利用与保护；第三章为生态学原理及其应用；第四章为农村能源的开发与环境；第五章为水污染及其防治；第六章为大气污染与控制；第七章为土壤污染及其防治；第八章为废弃物处理与资源化利用；第九章为乡镇企业污染与防治；第十章为农业环境监测与环境标准；第十一章为环境保护法与环境管理；第十二章为清洁生产与绿色食品。《教育部人才培养模式改革和开放教育试点教材:农村环保概论》每章前设有“本章学习目标”，章尾提供“复习思考题”供课后讨论，并在《教育部人才培养模式改革和开放教育试点教材:农村环保概论》末尾列出了重要的参考文献，以方便于课外查阅参考。