《现代生态农业》的读者对象是各级党政领导干部，农业工作者，农业产业化龙头企业厂长、经理和技术人员，有一定文化的农民和大专院校的学生。《现代生态农业》除绪论外共有五篇、二十二章。第一篇为基础理论篇，介绍现代生态农业的基本原理，并从传统农业和现代农业两个方面分析、论证现代生态农业的重要性和必要性；第二篇为初级生产篇，介绍植物生产有关领域的生态模式和生态技术；第三篇为次级生产篇，介绍动物转化方面有关领域的生态模式和生态技术；第四篇为分解还原篇，介绍微生物、蚯蚓和其他措施在处理生活污水、生活垃圾、农业废弃物方面的作用和相关技术。同时，还安排了专门介绍乡镇企业的清洁生产和生物能源的两个章节，目的是将生物净化功能和其他措施综合配套，共同为环境保护服务；第五篇介绍怎样为人民生产健康、安全的农产品，这既是《现代生态农业》的结尾，又是《现代生态农业》的最终目的，阐述了生态农业是生产健康、安全食品的可靠方法。发展现代生态农业为人民谋利益，是我们的出发点和归宿。该篇介绍了健康、安全食品的监测和生产技术体系。对大家关心的转基因食品单独作为一章，作了介绍。