《中医药与转化医学》中采用了大量生动的比喻和富有启示的寓言故事，来阐述系统生物学的一系列基本概念及其学术思想，特别是他巧妙地将一些源于外国的故事，改编成带有中国元素的故事和禅宗“寓言”以及采用汉字的类比，来说明他所倡导的系统一层次理论与狭隘的基因决定论及还原论之间的差异所在，使人读起来更加通俗易懂。