分子生物学在近几年中得到了空前的发展，同时也正在以十分迅速的速度向生物学的各个学科渗透。分子生态学就是分子生物学向生态学渗透的结果。其实分子生态学不仅仅是分子生物学和生态学的结合，而是一门多学科交叉的学科，它所研究的问题涵盖了进化、种群遗传学、生态学等学科，如生物种群在不同时间和空间的结构和动态及其进化历史、物种形成的机制、生物的遗传多样性、生态适应的分子基础、亲缘关系、亲子鉴定等等，其研究手段之一当然是分子生物学的方法。本书分为两个部分，第一部分是该学科的原理及方法，目的是让读者了解分子生态学的分子生物学背景，对专业人员有一定的参考价值；第二部分是一些具体的例子，叙述了如何利用各种分子标记来研究进化、种群遗传学、生态学中的种种问题，给读者一种感性认识，以便更好地理解分子生态学。