《临证指南医案》共十卷。卷一至卷八以内科杂病医案为主，兼收外科及五官科医案，卷九和卷十分别为妇科医案和儿科医案。全书序列八十九门，述证八十六种，每门以病证为标目，序列其经治医案，言简意赅，切中肯綮，于学术多有所体悟，于后学启迪甚多。每门之末附有论述该门证治大要的附论一篇，系由叶氏门人分别执笔撰写而成。
《临证指南医案》充分反映了叶天士辨证精细、立法妥帖、处方中肯、用药灵活的学术特点，书中治案大多切于临床实用，其中有关温热病医案的载述甚至成为后世医家编写温病专著的蓝本。
本次整理以清乾隆三十三年卫生堂刻本为底本，对全书重新点校，书前增加导读，书末附有病证名索引、方剂索引，使之更适合现代中医临床工作者阅读使用。

卷一 中风 肝风 眩晕 头风 虚劳卷二 咳嗽 吐血 失音 肺痿卷三 遗精 淋浊 阳痿 汗 脱 脾胃 木乘土 肿胀卷四 积聚 痞 噎膈反胃 噫嗳 呕吐 吐蛔 不食 肠痹 便闭 肺痹 胸痹 哮 喘 呃 疸卷五 风 寒 风温 温热 暑 湿 燥 疫 癍痧疹瘰 痰 痰饮卷六 郁 肝火 不寐 嘈 三消 脾瘅 疟 泄泻卷七 痢 便血 脱肛 痿 痹 痉厥 惊 癫痫卷八 衄 疝 头痛 心痛 胃脘痛 胁痛 腹痛 肩臂背痛 腰腿足痛 诸痛 且 目 鼻 牙 咽喉 疮疡卷九 调经 淋带 崩漏 胎前 产后 瘢瘕 热入血室卷十 幼科要略 痧疹 痘 疳 吐泻 痫痉厥 虫 集方病证名索引方剂索引