《生物技术和生物工程专业规划教材•发酵工程原理与技术》按照发酵工业生产过程进行编排，将各类发酵产品生产的共性原理和技术归纳成新的体系，全书共分五篇18章。第1章分别介绍发酵工程和生物工程的基础知识以及两者之间的关系。这些知识包括它们的概念、特点、研究领域和历史渊源及服务领域。第一篇：工业微生物和发酵工业原料。介绍发酵工业微生物菌种的选育和扩大培养，发酵工业原料选择、淀粉水解糖制备、发酵培养基的配制和灭菌，无菌空气的制备三部分。第二篇：发酵工程机理与过程控制。围绕发酵罐内进行的反应过程展开论述，重点介绍了氧的供需与传递、微生物发酵机理、发酵动力学、生物反应器、发酵过程工艺控制和染菌的防治。第三篇：发酵工程产物的获取。介绍了发酵工程下游技术的发展动态、细胞破碎的原理和技术，以及发酵产物获得所涉及的各种分离、纯化和精制的技术原理和方法。第四篇：与发酵工程相关的生物技术。
主要论述了动植物细胞大规模培养和固定化酶与固定化细胞的技术原理。第五篇：发酵工厂废物处理和清洁生产技术。本部分针对发酵企业排出的废弃物和废水的治理及资源化和清洁生产工艺展开论述。