《Protel99SE电路设计应用教程》以“设计印制电路板”工作过程为主线，采用图文并茂的“小人书 ”表达方式，介绍运用Protel 99SE设计电子线路的基本知识以及热转印、光转印等方法制作电路板的操作步骤。
全书共分为7章和3个附录，第1章介绍Protel 99SE软件安装、启动及菜单汉化的方法；第2章介绍运用Protel 99SE设计电路原理图文件和PCB文件的基本知识；第3章介绍选择、复制、拷贝和对齐对象等编辑原理图文件、 PCB文件的方法；第4章介绍定制图纸模板、原理图元件、PCB元件封装的具体操作；第5章介绍导入PCB元件的3种不同方法，以及Protel 99SE在设计电路原理图文件和PCB文件中的综合运用；第6章介绍“补泪滴”、“包地”、 “重编电路板元件的序号”等印制电路板高级设计技巧；第7章介绍PCB文件分图层打印输出，以及热转印、光转印方法制作电路板的具体操作；附录部分补充了对Protel 99SE软件的介绍。