《结肠炎症性疾病手册》共分7部分。第1部分为结肠解剖学。第2部分为病理知识。第3部分重点介绍国内外最新内镜技术。第4部分介绍了炎症性肠病的定义、分类、亚太地区诊疗共识意见与疾病活动性评估等内容；同时，分章介绍了特发性炎症性肠病的临庆特点及活动性、严重性评估等。第5部分为治疗篇。第6部分介绍了诊断困难且易与溃疡性结肠炎、克罗恩病发生混淆的各种常见的非感染性结肠炎症性疾病。第7部分分为特殊感染了一般感染性结肠炎。此外，《结肠炎症性疾病手册》还专列章节介绍了炎症性肠病与结肠、直肠恶性肿瘤的关系等内容。