《中国三清山生物多样性综合科学考察》对江西三清山地区的自然资源、生物资源、生态环境资源、景观资源进行全面调查，充分掌握该区域地质地貌、土壤资源、水资源、动植物多样性、昆虫多样性、植被类型、特色生态景观、旅游生态景观等特点，进而对该区域的自然保护、生态评价、旅游规划与管理规划等提供论证意见以及可靠的方案。整体目标通过考察、评价三清山地区的资源价值、科学价值,进一步阐明其社会经济价值，为三清山风景名胜区进行总体规划和管理提供基础资料和理论支持。同时，为三清山申报世界自然遗产提供关于生物多样性、生物学方面的直接依据。