《湖泊-流域生态系统管理研究》提出了系统性的流域生态系统管理理论、概念和研究方法体系，构建了由4个相互反馈的子模型组成的湖泊一流域生态系统管理综合模型。选用生物多样性和文化多样性均较为重要的四川邛海流域进行案例研究，提出了包含污染物治理、生态修复、生态水位以及渔业生态调控在内的管理策略，并对其时空分布进行了优化。以综合管理机制、管理对策以及适应性管理为核心，提出了邛海流域生态系统的适应性管理机制。
水体污染和湖泊富营养化已成为当前我国水环境领域的突出问题。流域生态系统管理作为解决这两大问题的重要途径，自20世纪90年代以来，成为国内外相关研究热点，代表了该领域的前沿发展方向。