《重庆:大城市带大农村协调发展》研究解决的关键问题有：一是西部大城市带大农村协调发展的基本原理，主要研究大城市带大农村的内涵、范围、主体、功能及协调发展原理；二是重庆市大城市带大农村协调发展的评估，其中包括研究大城市带大农村发展不协调的问题、特征、影响及原因；三是怎样实现重庆市大城市带大农村协调发展，研究的目标是探索大城市带大农村协调发展理论体系，用管理科学和计量经济的方法研究重庆市大城市带大农村协调发展的特征及障碍和发展战略。在分析重庆市大城市带大农村协调发展的问题、特征、影响及原因的基础上，研究重庆市大城市带大农村协调运行机制、发展模式及发展战略，使之具有可操作性。这项研究是宏观的、动态的，它首先致力于重庆市城乡发展的历史现状的分析，重点探索大城市带大农村协调发展的模式及运行机制，同时，研究的思路是新颖的，提供的角度与以往的研究也不同，它不仅仅是大城市的“带”的研究，还是大农村也要“动”的实施和机制的研究；其次是理论创新，主要包括大城市带动大农村、城乡协调发展的机理研究，即协调发展互动机理理论、大城市带大农村协调发展模式理论；最后是研究方法的创新，采用的是制度经济学与计量经济学相结合的研究方法。