《地下水系统保护研究》系统总结和分析了国内外出现的与地下水相关的生态环境问题及其成因。提出地下水系统保护的概念和标准。在前人研究的基础上。提出了地下水系统脆弱性由水质和水量两部分组成的概念，并对我国北方平原区开发利用脆弱性进行了评价；结合我国地下水系统的特点。研究了地下水质脆弱性分区的原则、标准，对全国各三级区的水质脆弱性进行了评价；提出了地下水系统保护的概念、开发与保护的原则和标准，研究了保护标准的确定方法；对我国主要超采区以及出现与地下水相关生态环境问题的地区，估算了地下水系统良性循环的最小需水量；对大连市海水入侵区、太原市山问盆地区、长江三角洲地面沉降区，以及内陆河流域和华北平原的部分地区进行了典型研究。提出了相应地下水系统保护标准与确定标准的方法。
《地下水系统保护研究》可供从事环境保护、水资源利用和国土规划各级管理人员和专门从事地下水开发、研究的工程技术人员使用。并可作为高等院校有关专业的教学参考书。