《三峡库区消落带生物多样性与图谱》内容分为上、中、下三篇，其中，上篇研究了三峡水库运行后对生物多样性的影响及对策，主要包括对消落带藻类植物、维管植物、无脊椎动物、脊椎动物的影响与对策研究；中篇、下篇分别为三峡库区消落带生物多样性名录与图谱。由于菌类、地衣和苔藓等种类繁多，鉴定工作难以短时间完成，因此经过筛选，择其具有代表性的具有重要生态学意义的动植物收入本图谱中。