《马克思经济理论》是以笔记为基础整理的，特别是第三、四篇，就是在笔记基础上进行整理而来的，因此它作为读书笔记的痕迹还很强。很多方面没有展开叙述。关于马克思经济理论的专题论文，一部分论文融入到了正文中，另一部分则作为各篇、章的附录。这些附录，有些是对马克思经济理论的进一步深入探讨，例如：《两大部类比例变化分析》、《马克思货币流通量与价格总水平模型》；有些是用马克思经济理论的理念对现实问题进行探讨，例如：《当前世界金融——经济危机的原因与后果》、《我国目前收入分配差距偏大分析——宏观效应、核心机制与解决对策》；还有一些是与西方经济学的比较，例如：《马克思价值理论与西．方经济学价值理论比较》、《价值转型问题》。由于附录均是已发表的论著，公式、图、表编号都保持了原状，因此与《马克思经济理论》正文中的公式、图、表编号不属一个体系，请读者阅读时稍加注意。
《马克思经济理论》对马克思经济理论提出了一些新的理解，例如，对《资本论》的结构、体系提出了新的见解：以历史唯物主义说明了经济范畴、经济制度和日常经济学的“三位一体”，说明资本、资本主义制度和资产阶级（政治）经济学“三位一体”构成《资本论》的研究对象；以辩证法说明了劳动二重性和商品两因素的矛盾展开所形成的经济范畴的演进，构成了《资本论》的理论体系。