《基因工程与分子生物学实验教程》在原理部分详细叙述了相应实验技术的理论知识，使操作人员能理解操作过程，从而能灵活而准确地进行实验操作，有助于学生理解实验原理，并根据各实验室所具有的仪器设备、材料等因地制宜进行实验。
《基因工程与分子生物学实验教程》分三个部分，第一部分为基础实验，共十四个独立的实验技术，前十个实验在动物DNA、植物DNA和质粒DNA提取的基础上，进行酶切，将酶切后的基因组DNA与从琼脂糖凝胶中纯化后的载体片段进行连接，同时PCR扩增目的片段，将目的片段从琼脂糖凝胶中纯化后与T载体进行连接。后面四个实验分别提供了从RNA水平和蛋白质水平检测基因表达的方法。