《应用分支理论基础》详细阐述非线性连续和离散动力系统中的分支理论及其在生物数学、化学反应、神经动力学等领域中的应用。全书共分十章，主要内容有动力系统介绍，拓扑等价性、分支与动力系统的结构稳定性，连续—时间系统平衡点的单参数和双参数分支，离散—时间系统不动点的单参数和双参数分支，n维动力系统的平衡点和周期轨道分支，双曲平衡点的同宿和异宿轨道分支，连续—时间动力系统中的其他单参数分支和分支的数值方法。《应用分支理论基础》尽量避免高深的数学概念和理论，证明(包括使用适当的计算机软件)详细清楚，介绍全面，便于多方面的读者阅读。
《应用分支理论基础》可作为大学数学、物理、生物等专业高年级大学生和研究生的教材或参考书，也可供相关专业研究人员阅读参考。