海洋是地球生物资源的巨大宝库，其中海洋微生物的种类可多达上亿种。随着现代生命科学与生物技术的进步，海洋微生物已成为先导化合物和海洋创新药物研究与开发的丰富资源。
《中华海洋本草:海洋药源微生物》分上、下两篇，共11章。上篇为海洋微生物基础，主要介绍海洋微生物的基础知识，包括海洋微生物的形态与结构、海洋微生物的生理与代谢、海洋微生物的遗传与进化、海洋微生物的生态与分布、海洋微生物的利用与开发、海洋微生物研究方法与技术等。下篇为海洋药源微生物及其活性物质，按海洋古菌、海洋细菌（真细菌、黏细菌、放线菌）、海洋原核藻类、海洋真菌（真菌、酵母菌）、海洋特殊环境微生物（深海高压、热液口、共附生、湿地、极地）等介绍海洋药源微生物和活性代谢产物及其功效等，共收录海洋药源微生物312种（株）。
《中华海洋本草:海洋药源微生物》可作为从事生命科学、海洋药物等科研、教学和开发工作的专业人员的参考书和工具书。