《天目山微生物学野外实习手册》是在国家自然科学基金委员会国家基础科学人才培养基金“天目山实习基地建设项目”资助下，由南京师范大学、浙江大学、复旦大学、南京大学、南京农业大学五所高校的微生物学教师联合编写而成的。内容包括土壤微生物、水体微生物、空气微生物、植物体微生物、大型真菌、地衣以及功能性微生物菌株的筛选。本手册尽量从野外实习实际出发设计实习内容，设法将微观世界的微生物用宏观的方法来观察，注重微生物与其周围的生态环境的关系和相互作用，并将微生物学野外实习与大学生科研训练相结合，力图为正在逐渐开展的微生物学野外实习提供一本适用的教材。《天目山微生物学野外实习手册》虽取名为“天目山微生物学野外实习手册”，但野外实习内容和方法仍适合于其他地区的微生物学野外实习作参考。
《天目山微生物学野外实习手册》适于用作普通高等学校生物科学、生物技术及相关专业微生物学野外实习教材，也可供相关领域科研工作者参考使用。