《计算机软件版权保护的反思与超越》集中讨论了两个问题：其一，如何看待软件版权保护，其二，如何看待软件专利保护。围绕这两个问题，《计算机软件版权保护的反思与超越》进一步谈了两方面的构想：其一，如何改进软件版权保护，其二，如何设定软件专利的授权和审查条件。此外，《计算机软件版权保护的反思与超越》还就软件专门立法以及软件知识产权保护体系的理想模式进行了展望。
《计算机软件版权保护的反思与超越》的主要观点可以简要概括为：软件版权保护和软件专利保护各有长短。现阶段应坚持版权保护为基础，绝大多数软件通过版权获得最基本的保护。不排除以专利保护为前导，少数先进软件可以获得专利。未来在适当时候启动专门立法，通过工业版权制度结合版权和专利的长处，最终解决软件的保护问题。