《微生物学》主要包括绪论，原核微生物形态、结构与功能，真核微生物的结构与功能，病毒和亚病毒，微生物的营养，‘微生物新陈代谢，微生物的生长，微生物遗传与育种，微生物生态，微生物进化、分类和鉴定，免疫学概论，工业微生物，食品微生物学等内容。
为了更好地了解和掌握现代微生物学的发展方向和新知识，《微生物学》还着重介绍了遗传学和免疫学等方面知识。