《微生物学实验教程》编写的中心思想是以基础实验为前提，进一步提高学生的综合素质，从而发挥学生的创造性、自主性。全书内容全面、系统，图文并茂，兼顾理论性、科学性、系统性和实用性，其内容涉及微生物在工业、农业、环保、医疗和食品等领域的应用。全书共分为三部分：第一部分，基础性实验的内容包括：微生物的形态、结构、营养、生长、选育保藏、生理生化以及免疫学试验等，主要使学生掌握基本的实验理论知识和操作技能；第二部分，综合性实验的内容包括：遗传物质的提取鉴定、水质检测、发酵的工艺流程以及免疫分析试验等，主要培养学生综合运用知识的能力；第三部分，研究性实验的内容包括：菌株选育和鉴定、基因表达以及发酵条件的优化等，着重培养学生在掌握基本理论和操作技能的基础上的创新能力。书后附有附录和参考文献，供读者查阅和参考。
《微生物学实验教程》适合高等院校生物科学与工程类、农学类、环境科学与工程类、食品科学与工程类以及药学类各专业学生学习使用，也可供相关专业人员查阅和参考。