《医学化学实验》由五个章节和附录组成：第一章为化学实验基本知识；第二章为化学实验常用仪器；第三章为化学实验基本操作；第四章为基础性、综合性实验，选编了45个实验；第五章为设计性实验，选编了12个设计性实验；最后为附录部分。教材中的部分实验编人了英文阅读资料。
《医学化学实验》打破化学二级学科的界限，将以往分割的无机化学、分析化学、物理化学和有机化学等二级学科的实验内容优化整合，按基础、综合、设计三个层次编排。在内容上力求体现“三基”（基础理论、基本知识、基本技能）和“五性”（思想性、科学性、先进性、启发性、实用性），同时注重教材体系的合理科学，旨在通过化学实验，训练学生的基本操作和基本技能，培养学生综合运用化学知识分析问题和解决问题的能力，充分激发学生的创新意识和探索精神。
《医学化学实验》适合高等医药院校基础临床、预防、检验等医学类和药学专业的学生使用，也可作为相关专业工作者的参考书。