《中医药系统生物学》是清华大学中药现代化研究中心多年探索、创新研究工作的总结，系统阐述了作者在中医药系统生物学研究方面的学术思想、技术路线、方法体系及相关应用成果。全书原创性强，技术前沿，体现了以下特色:提出了适合中医药研究的中医药系统生物学研究体系;提出了创新的研究模式，即从“点一点”、“点一系统”发展到“系统一系统”的模式;阐述了创新的研究策略，针对复杂系统，提出采用层次化、整合各种组学(包括化学物质组学和系统生物学)的方法和逐步优化的策略来研究“系统一系统”的相互作用;阐述了创新的研究方式，针对化学和生物的复杂系统，提出采用整体表征和局部特征相结合、定性测定和定量测定相结合、多学科先进技术的整合等研究方式;发展了创新的研究方法和技术，如化学物质组学、定量代谢组学平台技术等。
《中医药系统生物学》可作医药院校相关师生的学习参考书，也可供制药企业、科研院所从事中药研究与开发、药品生产和质量管理等相关专业技术人员和科研管理人员作为技术指导参考书。