《分子昆虫学》共8章，涵盖分子昆虫学的核心内容，包括昆虫的基因组及其基因（第一章）、昆虫分子系统发生分析（第二章）、昆虫种群的基因流动（第三章）、昆虫行为的分子基础（第四章）、昆虫抗药性的分子基础（第五章〉、昆虫变态发育及转基因昆虫（第六章）、昆虫内共生菌Wolbachia（第七章）以及基因组学在昆虫学中的应用（第八章）。此外，《分子昆虫学》还设置6个基本实验，对于初学者尤为适用。上述内容大多与笔者自身的研究工作紧密相连，特别?案例和实验。书中所列所有实验都经过笔者的实验验证，因而操作性很强。