《明清社会经济史论文集》的编选内容，顾名思义以明清两代为限。分为：卷一，封建经济与资本主义萌芽问题；卷二，农业、手工业；卷三，商业、贸易与市镇；卷四，财政、金融；卷五，阶级、阶级斗争。在排列次序上将按专题性质和时代前后为分类标准，然后再参照写作年代排列，使同类问题能历史地看出作者研究历程的变化。尽管所收文章颇为分散，并不集中，且非一时之作，但总的看来却围绕着我的一贯研究中心，即从各角度反复论证、探讨中国封建社会的长期迟滞问题。