《中医藏象辨证论治学》为具有一定创新性的中医药综合性学术专著，内容分为五章。第一章对辨证论治的历史沿革作了回顾，对八纲辨证、六经辨证、卫气营血辨证、三焦辨证、经络辨证、脏腑辨证、气血津液辨证、病因辨证诸法作了评析。
第二章就确立“藏象辨证论治”体系的重要性、必要性和可行性作了阐发。
第三章对肝胆、心小肠、脾胃、肺大肠、肾膀胱及女子胞、三焦等藏象生理作了详尽论述，其间涉及形质结构、经络联系、生理特性、生理功能及生理联系。
第四章是“藏象辨证论治”与定位、定性和定量。其中包括脏腑经络定位、病因病机定性、系统模糊定量等内容。
第五章是“藏象辨证论治”，为《中医藏象辨证论治学》的核心内容。分为辨证与论治两大部分。
辨证部分，按肝、心、脾、肺、肾五大系统病证及三焦病证、脏腑相兼病证分别论述。
论治部分，首论重要论治法则及用药，包括六淫犯脏用药、脏腑虚实标本用药、五脏五味补泻用药、引经报使用药诸法则，以及脏腑病补泻温凉药物举要。次述脏腑病论治，也按肝、心、脾、肺、肾五大系统病证及三焦病证、脏腑相关病证分述，其内容包括脏腑病治法、适应证、常用方药、医方必备及医案辑要。