《中国长江三峡植物大全(上下)》分为上、下卷，书中收编了长江三峡坝库区的维管植物5582种（含种下等级），分隶于242科1374属。蕨类植物按秦仁昌系统排列，裸子植物按郑万钧系统排列，被子植物按哈钦松系统排列，科内属、种则按拉丁文的顺序排列。书中对1863种植物配置了插图。书后附录有以三峡宜昌地域命名的植物53种，模式标木采自三峡宜昌的植物270种。每种植物叙述的主要内容有中文名、拉丁名、保护级别、形态特征、生长环境和主要用途等。植物名称尽量使用了地方习惯用名。对栽培引种的植物，大多数也列出了其原产地。为了查阅方便，编排了两种查阅方式，即中文名和拉丁名便查系列。
《中国长江三峡植物大全(上下)》适用于林业、农业、园林、植物学研究人员，以及从事长江流域生态环境研究的各界人士参考使用。