《医学信息系统应用基础》作为全国高等医药院校“医学计算机基础与应用”基础系列课程的主教材之一，共12章，分别介绍了医学信息系统概论、医院信息系统、典型医院信息系统需求分析与总体设计、医院药房管理、医院信息标准化建设、电子病历与健康档案、医院信息系统中的医学影像信息处理系统、医学实验室信息系统、中医药信息处理、公共卫生信息系统、医学信息系统硬件平台、信息系统的安全与运行管理等内容。
《医学信息系统应用基础》提供完整和开放的教学资源共享的网络互动平台，以期达到助学助教、多校合作、交叉互动、共同提高的教学效果。
《医学信息系统应用基础》适合医药学类院校各专业作为教材施用，亦可作为相关培训班的教材或参考书，同时可供具有一定计算机应用基础的读者作为自学提高用书。