《地缘政治视野下的西南周边安全与区域合作研究》研究的主要问题可以分为三个大的方面。一是对“地缘政治经济学”进行初步的概念界定与理论探索，并尝试性提出地缘政治经济学的分析框架。二是对中国西南周边安全和区域合作的互动关系进行理论分析，对两者之间的相互影响与制约作用进行探讨。三是对选择中国与东南亚、南亚国家开展合作过程中的几个关键问题进行实证分析，主要包括从角色、利益与制度的角度研究大湄公河次区域经济合作，从公共产品的视角分析后金融危机时代的中国与大湄公河次区域国家的关系，从大国因素的角度分析其对中国西南周边安全和区域合作的影响，从非传统安全问题的角度分析其对中国西南周边安全和区域合作的影响，最后还特别对中国西南与周边国家的能源合作以及云南在中国周边安全与区域合作中的定位与发展进行专题研究。