《重庆生态环境保护》结合当前国内外生态环境保护的理论与技术、生态环境保护研究建设等领域取得的成功经验，从介绍生态学的理论与环境相关的技术着手，重点介绍重庆市自然生态系统及特征、重庆市生态环境建设历程、重庆市的生物多样性保护、森林重庆建设、长江流域防护林体系建设工程、重点生态建设工程、三峡库区的生态环境保护、重庆市水资源保护与可持续利用、重庆市的自然保护区建设及重庆市生态示范区县建设等内容。