《系统包含原理及其应用》首先介绍了系统包含原理中系统状态、输入和输出包含的一般概念，给出了包含原理在电力系统和自动车组系统重叠分散控制中的应用，以及在空间系统应用中模型降阶的方法。其次，提出了系统对偶包含的概念，说明了约束类和聚集类包含条件的对偶性，使得系统控制器与观测器的设计可以通过对偶性相互转换。最后，将系统包含原理推广到了子系统的包含，从而可以研究在任意信息结构约束变化下，系统的多重叠分散控制和系统分散的一致性协调控制。
第1章除综合介绍系统包含原理的理论发展和应用的研究方向外，还将线性随机离散时变状态方程和线性随机连续定常状态方程，作为系统的数学描述工具。第2章重点介绍系统包含原理的基本概念，以及系统包含的约束类条件和聚集类条件。第3章以重叠互联电力系统为例，详细讨论两区域电力系统重叠互联结构模型的分解，及其自动发电控制（AGC）的分散次优LQG控制方法。第4章以两类自动车组系统为例，给出自动车组系统中两两汽车构成子系统的重叠结构分解方法，及其重叠分散控制方法。第5章从系统对偶原理的角度，以一个空间结构系统为例，介绍利用系统的包含原理进行复杂系统和大系统模型降阶的一般方法，给出系统模型降阶控制器的设计方法；同时，归纳并提出系统的对偶包含原理。第6章通过系统的多重叠结构分解，研究特殊结构系统子系统的包含问题及其多重叠分散控制方法。第7章推广到更具普遍意义的一般结构系统的广义包含原理，即通过基本互联子系统的对对分解。