《伤寒全生集》成书后即刊行于世，全书共四卷，约14万言，内容包括序、凡例（据叶眉寿堂藏版补入）、目录和正文四部分。目录分属各卷之前（此次整理增补了总目录，以方便读者），正文四卷分为两大部分，第一部分为总论及六经标本，表里阴阳，寒热虚实，正伤寒，温热病，具阴证，类伤寒，阴阳相似，合病，并病，风温，痉症，疫疬天行等；第二部分为各种症状及证候的辨证论治，并列方药及加减变化，即所谓“辨一证，则立一方。一方之中，出入加减，更察其病情变态，临证用药，便能奏效非常”。书中收部分针灸之法，“颇有愈病之功，且助汤药所不及”。

原序伤寒全生集序刘序刻《全生集》评本书后原凡例凡例陶节庵伤寒全生集卷之一伤寒总难提纲第一辨正伤寒温病热症论第二辨伤寒伤风中寒不同论第三辨伤寒审证问因察形正名总论第四辨持脉手法例第六辨论浮脉形状指法主病例第七辨中脉形状指法主病第八论沉脉形状指法主病第九辨内外伤证治不同论第十伤寒太阳脉似少阴少阴证似太阳用药不同论第十一伤寒阴证身热面赤认作阳证误治论第十二伤寒合并病论第十三伤寒两感误治论第十四伤寒寒热二厥论第十五伤寒统论第十六伤寒标本论第十七伤寒传足不传手经论第十八三阴无传经论第十九治伤寒症病所察病人色法第二十治伤寒症病所察病人声法第二十一治伤寒症病所察病人形体法第二十二治伤寒症病所察病人鼻法第二十三治伤寒症病所察病人口唇齿牙法第二十四治伤寒症病所察病人耳法第二十五治伤寒症病所看病人目法第二十六治伤寒症病所察病人舌法第二十七治伤寒症病所按病人心胸有无痛处法第二十八治伤寒症病所问其大小便通利法第十九治伤寒症病所问其渴与不渴法第三十治伤寒诸禁忌法第三十一足太阳经见证治例第三十二足阳明经见证治例第三十三足少阳经见证治例第三十四足太阴经见证治例第三十五足少阴经见证治例第三十六足厥阴经见证治例第三十七辨伤寒凭证不凭脉凭脉不凭证第三十八辨伤寒见风脉伤风见寒脉论第三十九察内外伤口传心受脉法第四十辨伤寒急温急下论第四十一辨伤寒脉浮可下脉沉可汗论第四十辨伤寒可发汗例第四十三辨伤寒不可汗例第四十四辨伤寒可下例第四十五辨伤寒不可下例四十六辨伤寒可吐例第四十七辨伤寒不可吐例第四十八辨伤寒可温例第四十九辨伤寒不可温例第五十用药寒温相得论第五十一陶节庵伤寒全生集卷之二陶节庵伤寒全生集卷之三陶节庵伤寒全生集卷之四附录 伤寒全生集书影选录