《 思想研究》全面阐述了该论在虚妄分别、三性、中道和心识结构上的理论特色，指出该论的非空非有中道说是唯识中道说的核心理论：该论所说的心摄一切有为法、有染净转变，心性是无为法、本性清净的思想亦成为瑜伽行派阐释心性的基本学说。另外，通过对该论和其他经论的比较分析，《 思想研究》从六个方面具体阐述了唯识与中观在佛学要义上各有宗趣却又殊途同归的特色；还对唯识古学与今学的异同从四个方面加以了总结，指出二者异议的根源在于对心识结构、三性等要义的不同理解和诠释。