李永健、陈喜编著的《分子模拟基础》是分子模拟的一本入门书。书中简要介绍了分子模拟的基础理论知识，详细介绍了利用Gaussian03软件来研究计算分子的单点能、电荷的分布、偶极距的计算、几何构型的优化、频率的计算、过渡态的寻找及化学反应途径的研究。《分子模拟基础》中还编入了七个上机实验，内容主要包括单点能、频率的计算、过渡态的寻找和化学反应途径的研究。最后还介绍了Gaussian View的使用方法和操作技巧。